11 Capítulo 11 — Antibióticos y administración de la RAM
Epidemiología aplicada en acuicultura — Parte IV: Intervenciones
Dónde encaja esto — Responder (terciaria) y Resguardar (cuaternaria). Los antibióticos son la principal herramienta de Responder una vez establecido un brote. Pero su sobreuso es la principal preocupación de Resguardar —la consecuencia no deseada que la prevención cuaternaria existe para minimizar—.
11.1 Panorama
Cuando el SRS se afianza, los antibióticos son la respuesta de último recurso —y en Chile la dominante: el SRS impulsa cerca del 94 % del uso de antimicrobianos de la industria del salmón—. Este capítulo hace dos trabajos. Primero, Responder: cómo medir si el tratamiento funciona, y por qué las comparaciones ingenuas de “tratado vs. no tratado” engañan. Segundo, Resguardar: cómo leer antibiogramas y CIM, rastrear la resistencia en el tiempo y aplicar la administración (stewardship) que mantiene útiles estos fármacos —porque el modelo actual centrado en el tratamiento es un ciclo autorreforzado de menor efectividad y mayor resistencia (Diethelm-Varela et al., en prensa)—.
Usamos amr_isolates.csv: 427 resultados de susceptibilidad a florfenicol de P. salmonis, 2017–2025, con CIM, S/I/R y genogrupo.
11.2 11.1 Preparación
pacman::p_load(rio, here, tidyverse, janitor)
amr <- import(here("data", "amr_isolates.csv"))11.3 11.2 Medir el efecto del tratamiento — y su trampa
El instinto es comparar la mortalidad en jaulas tratadas vs. no tratadas y llamar a la diferencia el efecto del tratamiento. No lo hagas —está arruinado por la confusión por indicación: las jaulas que se tratan son las enfermas, así que una comparación ingenua puede hacer ver inútil o hasta dañino a un antibiótico efectivo—. La evidencia válida necesita un contraste antes/después dentro de las unidades tratadas, o ajuste por severidad (la caja de herramientas del Capítulo 9).
Aun con una comparación justa, la efectividad del tratamiento del SRS es limitada por una razón que no es resistencia en absoluto: cerca del 40 % de los peces tratados con florfenicol nunca alcanzan concentraciones terapéuticas en tejido en terreno, porque la dosis se entrega en el alimento a animales de peso y apetito variables (Price et al., 2018, 2019). Muchos “fracasos de tratamiento” son fracasos de entrega.
11.4 11.3 Leer el antibiograma
La susceptibilidad se resume con la concentración inhibitoria mínima (CIM) —la menor concentración que detiene el crecimiento— clasificada contra puntos de corte en S/I/R (susceptible / intermedio / resistente):
tabyl(amr, sir) # distribución de S / I / R
amr |> group_by(genogroup) |>
summarise(pct_R = mean(sir == "R") * 100)Dos reglas mantienen honesta la lectura. Primero, la CIM solo es comparable dentro de un mismo método y laboratorio. Segundo, resume la distribución, no solo una media: un histograma bimodal de CIM (un grupo susceptible y uno resistente) te dice que una subpoblación resistente está emergiendo mucho antes de que la mediana se mueva.
11.5 11.4 Rastrear la resistencia en el tiempo
La resistencia es un blanco móvil, así que vigilar la susceptibilidad es en sí una actividad de Resguardar. La proporción de aislados con susceptibilidad reducida a florfenicol subió en el período:
amr <- amr |> mutate(nwt = as.integer(mic >= 4))
amr |> group_by(year) |> summarise(pct_nwt = mean(nwt) * 100)
# 2017 ~37% ... 2025 ~85%
glm(nwt ~ year, data = amr, family = binomial) |> broom::tidy(exponentiate = TRUE)
# year OR 1.23 (odds de no-tipo-silvestre sube ~23% por año, p < 0.001)Los valores año a año son ruidosos —por eso se prueba la tendencia con un modelo en lugar de comparar dos extremos—. Aquí los odds de que un aislado sea no-tipo-silvestre suben cerca del 23 % por año (OR 1,23, p < 0,001): un ascenso inequívoco, consistente con el panorama nacional de susceptibilidad reducida concentrada en el genogrupo dominante LF-89-like (Rozas-Serri, 2026).
🧮 Epivet Tools — Prueba de tendencia (χ²) Evalúa una tendencia de resistencia en el tiempo: tools.epivet.cl/chi-trend. Modelo de referencia: Ausvet EpiTools.
11.6 11.5 La visión de Resguardar: la RAM como consecuencia no deseada
La prevención cuaternaria pregunta qué daño causan las propias medidas de control. Para el SRS la respuesta es cruda y autorreforzada:
- Dependencia de un solo fármaco — el florfenicol es ~97,6 % de todos los antimicrobianos prescritos.
- Un círculo vicioso — la dosificación variable deja ~40 % de los peces subterapéuticos, lo que reduce la efectividad y selecciona resistencia, lo que impulsa más tratamiento.
- Desborde más allá del centro — el tratamiento prolongado selecciona bacterias intestinales multirresistentes en el salmón (Higuera-Llantén et al., 2018), y los genes de resistencia se acumulan en los sedimentos —la apuesta de Una Salud—.
La administración es la respuesta de Resguardar: confirmar antes de tratar (Capítulo 6), elección de fármaco guiada por CIM, dosificación correcta por peso y temperatura, inyectable sobre en-alimento donde sea farmacocinéticamente justificado, vigilancia genómica de la RAM y —lo más potente— fortalecer las capas de Anticipar y Prevenir río arriba para que menos brotes requieran tratamiento.
11.7 11.6 Interpretación en el centro de cultivo
Las dos mitades de este capítulo son inseparables. Una decisión de Responder —echar mano del florfenicol— es a la vez una decisión de Resguardar que empuja hacia arriba la curva de resistencia de §11.4. El camino disciplinado es tratar temprano, bien dosificado y confirmado, rastrear la susceptibilidad como salida de rutina, y juzgar cada curso de antibiótico por su aporte a la tendencia de resistencia, no solo por la mortalidad de este ciclo. La palanca máxima de administración es el resto de este libro: cada brote prevenido es un curso de antibióticos nunca administrado.
11.8 11.7 Ejercicios
Inténtalo tú (11.1). Produce la distribución S/I/R y el porcentaje resistente por genogrupo. ¿Qué genogrupo porta más susceptibilidad reducida, y por qué importa para elegir el tratamiento?
11.2 Ajusta la tendencia logística de no-tipo-silvestre sobre el año y reporta la razón de odds. Explica por qué es más confiable que comparar directamente los porcentajes de 2017 y 2025.
11.3 Un encargado compara la mortalidad en jaulas tratadas vs. no tratadas, halla que las tratadas fueron peor y concluye que el florfenicol es inútil. Nombra el sesgo y propón un análisis más justo.
11.4 Lista tres acciones de administración que reducen la selección de RAM sin reducir el cuidado de los peces enfermos, y clasifica cada una como Responder o Resguardar.
11.5 Explica cómo fortalecer Prevenir (Capítulo 10) y Anticipar (Capítulo 5) reduce el uso de antibióticos —el argumento de prevención cuaternaria en un párrafo—.
11.9 Resumen y qué sigue
- Las comparaciones ingenuas tratado-vs-no-tratado sufren confusión por indicación; muchos “fracasos de tratamiento” del SRS son fracasos de entrega (~40 % subterapéuticos).
- La CIM y el S/I/R resumen la susceptibilidad, comparables solo dentro de un método/laboratorio; lee la distribución, no la media.
- Las tendencias de resistencia son ruidosas —pruébalas con un modelo; aquí la susceptibilidad reducida a florfenicol subió ~23 % por año—.
- La prevención cuaternaria (Resguardar) apunta a la RAM como consecuencia no deseada del tratamiento.
En el Capítulo 12 — Vigilancia y alerta temprana volvemos a Detectar a nivel de sistema.
11.10 Referencias y lecturas
- Diethelm-Varela B, Atero N, Gelcich S, Gallardo A, Mardones FO. Evidencia de terreno sobre el manejo de P. salmonis: una revisión sistemática (prevención cuaternaria). Reviews in Aquaculture, en prensa.
- Higuera-Llantén S, et al. El tratamiento antibiótico prolongado selecciona bacterias intestinales multirresistentes en el salmón. PLoS ONE. 2018.
- Price D, et al. Farmacocinética del florfenicol y exposición subterapéutica. Prev Vet Med. 2018;156:16–21; Aquaculture. 2019.
- Montt R, Mardones FO, Reyes P, Rojas H. Agrupamiento espacial del uso de antimicrobianos y mortalidad por SRS. Aquaculture, en prensa.
- Rozas-Serri M. Septicemia rickettsial del salmón: una revisión. Reviews in Aquaculture. 2026.
Archivos de este capítulo: data/amr_isolates.csv y scripts/make_amr_isolates.R.