Catálogo de conjuntos de datos

Cada conjunto de datos es simulado con fines docentes y se reproduce exactamente con su script con semilla en scripts/. Todos usan las tres operaciones: Aysén Salmón S.A., Tilapia Lago Verde, Camarones del Golfo.

Archivo (data/) Filas Usado en Qué contiene Generador (scripts/)
aquafarms_register.csv 24 Cap. 2–3 foto de salud de un mes por unidad make_aquafarms_register.R
weekly_monitoring.csv 36 Cap. 4, 13 cohorte de 12 semanas por centro con un brote make_weekly_monitoring.R
bkd_watersource.csv 16 Cap. 5, 7 BKD por fuente de agua (río vs. RAS) make_bkd_watersource.R
srs_diagnostics.csv 400 Cap. 6 qPCR, Ct, cultivo vs. estado de referencia make_srs_diagnostics.R
srs_confounding.csv 1000 Cap. 9 piojos, SRS, estación (confusión) make_srs_confounding.R
srs_vaccine.csv 60 Cap. 10 vacunados vs. no: mortalidad + tiempo al brote make_srs_vaccine.R
amr_isolates.csv 427 Cap. 11 CIM de florfenicol / S-I-R por año y genogrupo make_amr_isolates.R
regional_srs_weekly.csv 104 Cap. 12, 13 conteos regionales semanales de 2 años make_regional_srs_weekly.R
farms_spatial.csv 40 Cap. 14 coordenadas de centros + mortalidad por SRS make_spatial_network.R
movements.csv ~113 Cap. 14 lista de aristas de movimientos sitio a sitio make_spatial_network.R
lice_srs_studies.csv 6 Cap. 15 tamaños de efecto por estudio para metaanálisis make_meta_studies.R
srs_challenge_families.csv 2000 Cap. 16 supervivencia en test de desafío por familia make_srs_challenge_families.R

Regenerar un conjunto de datos

# desde la raíz del proyecto, en R:
source("scripts/make_aquafarms_register.R")

Cada script fija una semilla, así que volver a correrlo reproduce el archivo idéntico.


Soluciones de los ejercicios

Las soluciones trabajadas de los ejercicios de fin de capítulo se mantienen por separado y se publican junto a la edición docente. Cada ejercicio está diseñado para resolverse con el código mostrado en su capítulo.