Epidemiología Aplicada en Acuicultura
Una guía práctica con R
Prefacio
Bienvenido a Epidemiología Aplicada en Acuicultura — un curso práctico de epidemiología veterinaria escrito para quienes mantienen sanos a los peces y camarones de cultivo, y enseñado íntegramente a través de R y de problemas reales de la acuicultura.
Edición bilingüe. Este es el texto en español. The English edition is available at ../.
Para quién es este libro
Médicos veterinarios de salud de peces, encargados de salud en acuicultura, personal de laboratorios de diagnóstico, reguladores y estudiantes de posgrado. No se asume experiencia previa en programación: el Capítulo 2 instala R desde cero, y cada método se muestra como código que puedes copiar, pegar y ejecutar sobre los propios conjuntos de datos del libro.
Cómo está organizado el libro
El libro sigue una única columna vertebral —el marco de cinco niveles de prevención para la salud de los animales acuáticos (Mardones, Aquaculture Health Management, 2020)—, expresado como cinco fases del manejo de enfermedades:
| Fase | Nivel de prevención | Pregunta que responde |
|---|---|---|
| Anticipar | primordial | ¿Qué aumenta el riesgo antes de que aparezca la enfermedad? |
| Prevenir | primaria | ¿Cómo evitamos que ocurran los brotes? |
| Detectar | secundaria | ¿Cómo encontramos la enfermedad a tiempo? |
| Responder | terciaria | ¿Cómo limitamos el daño una vez presente? |
| Resguardar / Revisar | cuaternaria | ¿Cómo evitamos los daños del control y aprendemos? |
Cada capítulo abre con un recuadro “Dónde encaja esto” que nombra su fase, de modo que siempre sepas qué capa de defensa estás construyendo. La genética del patógeno y la resistencia del hospedador atraviesan las cinco fases, por lo que la genética (Capítulo 16) recorre todo el libro.
Los dos centros de cultivo (y un estanque de camarón)
Cada ejemplo corre sobre tres operaciones recurrentes: Aysén Salmón S.A. (salmón del Atlántico, jaulas marinas frías + RAS), Tilapia Lago Verde (estanques dulceacuícolas cálidos) y Camarones del Golfo (camarón patiblanco, estanques salobres). Sus enfermedades emblemáticas —SRS, estreptococosis y AHPND— aparecen a lo largo del texto.
Calculadoras en línea
Cada método que se enseña aquí en R tiene una calculadora en línea gratuita en Epivet Tools, enlazada desde el capítulo correspondiente, para quien quiera correr el cálculo sin R. Están modeladas sobre Ausvet EpiTools y usan las mismas fórmulas que el libro.
Este libro está en desarrollo. Los conjuntos de datos son simulados con fines docentes y no son registros reales de cultivo. Las cifras atribuidas a trabajos “en revisión” o “en preparación” reflejan trabajo futuro de los autores y pueden cambiar al publicarse.
Comencemos donde comienza toda investigación: con una población de peces.